La actividad académica del CARI es llevada a cabo por un equipo de trabajo que organiza el funcionamiento general de la institución. El componente fundamental de este esquema es la Secretaría Académica, la cual maneja la agenda del Consejo y coordina el trabajo de los distintos Institutos, Comités y Grupos de Trabajo. Estos mismos desarrollan sus actividades cubriendo temas y regiones diferentes y están integrados por expertos que colaboran ad-honorem con el Consejo
La labor de estos Institutos, Comités de Estudio y Grupos de Trabajo es extensa en cuanto a temas y regiones y variada en cuanto a sus formas de trabajar. Ellos constituyen una pieza central en las actividades del Consejo, ya sea organizando publicaciones, seminarios o conferencias públicas o reuniones de consulta con funcionarios públicos y expertos de la sociedad civil
Han funcionado además los siguientes Comités de Estudios Especiales: Proyección Externa de la Empresa Argentina, La Argentina en el Proceso de Reestructuración de la ALALC, El Ingreso de España en la Comunidad Europea: Posibles Impactos en las Relaciones Económicas de la Argentina con España, Servicio Exterior Argentino, Deuda Externa, La Argentina como Productor Mundial de Alimentos, Seguridad Latinoamericana, Financiamiento Externo, Comercio Exterior, Reforma Económica Argentina, El NAFTA y la Unión Europea y Reforma del Consejo de Seguridad